Valeggio dista 27 chilometri da Verona (rispetto capoluogo è posizione sud-ovest) ed è attraversato dal primo tratto del fiume Mincio, il principale emissario del lago di Garda, situato alcuni chilometri più a nord.

Confina a nord con Peschiera del Garda e Castelnuovo del Garda, a est con Sona, Sommacampagna e Villafranca di Verona, a sud est con Mozzecane e sud e a ovest con comuni mantovani di Roverbella, Marmirolo, Volta Mantovana, Monzambano Ponti sul Mincio.

L'area comunale, di 63,96 km², si estende dalle colline moreniche del lago di Garda nord fino al confine meridionale con Mantovano e Bassa Veronese.

È attraversato anche dal canale Virgilio dalla Seriola Prevaldesca (XVI secolo, ad opera della Repubblica di Venezia rispettivamente alla destra alla sinistra idrografica del Mincio, due canali irrigui che nascono dal Mincio in corrispondenza dello sbarramento artificiale nella frazione di Salionze (circa km nord del capoluogo).